La máxima autoridad académica de la Universidad es el Rector, que ejerce su representación institucional y desarrolla su labor acompañado por el Equipo Rectoral.
Dentro de los órganos generales de gobierno destacan el Claustro Universitario, como espacio de representación de la comunidad universitaria, y el Consejo de Gobierno, encargado de la dirección y gestión ordinaria de la institución.
La Universidad también cuenta con el Consejo Social, órgano que conecta la actividad universitaria con la sociedad y favorece la relación entre la institución y su entorno.
En el plano más cercano al estudiantado, cada centro dispone de su Junta de Centro y articula su actividad docente junto a departamentos, cuyo órgano de gobierno es el Consejo de Departamento.